Nacido en la ciudad de Jackson, California el 2 de junio de 1869, Raphael estudió con Arthur F. Mathews en la Escuela de Diseño de California. En 1902 ingresó en la École nationale supérieure des Beaux-Arts de París, pero luego se trasladó a la Académie Julian y estudió con Jean-Paul Laurens.
Pasó parte de los años siguientes en los Países Bajos, produciendo pinturas en un estilo oscuro derivado de los maestros holandeses. En 1906 su gran óleo La Fete du Bourgmestre recibió una mención de honor en el Salón de París; Posteriormente fue comprado por un grupo de amigos en San Francisco y entregado a la Asociación de Arte de San Francisco.
En 1910 tuvo una exposición individual en el Instituto de Arte de San Francisco; a partir de 1913 tuvo exposiciones anuales en las Galerías Helgesen, San Francisco. Enviaba obras de arte a su amigo y mecenas de San Francisco, Albert M. Bender, quien compraba algunas y animaba a sus amigos a comprar otras. Raphael también participó en las exposiciones colectivas anuales de la Asociación de Arte de San Francisco.
En poco tiempo adoptó un estilo tomado del impresionismo francés, eventualmente utilizando pinceladas más amplias, más libres y más posimpresionistas. En 1912 estaba casado y vivía en Uccle, Bélgica, un suburbio de Bruselas.
Produjo muchas pinturas del campo cerca de su casa. A medida que crecía la reputación internacional de Raphael, su familia también creció, para incluir cuatro hijas y un hijo. Su familia aparecía con frecuencia en sus obras figurativas. A principios de la década de 1930, Raphael y su familia vivían en un suburbio de Leiden, Holanda, y pintaba a menudo en las cercanías de Brujas.
En 1939, cuando se acercaba la Segunda Guerra Mundial, regresó a San Francisco, donde vivió y mantuvo un estudio en Sutter Street hasta su muerte el 11 de diciembre de 1950.
Conocido principalmente como pintor, Raphael también fue un hábil grabador, creando numerosos grabados y xilografías en color de escenas europeas y del Área de la Bahía de San Francisco.
